パンコロナウイルス薬の最も有望な標的を見つける

by REVOLUSYNAPSE
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安全で効果的なワクチンは、COVID-19パンデミックの終焉への希望を提供します。 ただし、ワクチン耐性のSARS-CoV-2変異体、および新規の出現の可能性 コロナウイルス、すべてのコロナウイルスに対して機能する治療法を見つけることがこれまでになく重要になります。 現在、ACSで報告している研究者 プロテオーム研究ジャーナル は、27のコロナウイルス種とCOVID-19患者からの数千のサンプルにわたるウイルスタンパク質を分析し、最良の創薬ターゲットとなる可能性のある高度に保存された配列を特定しました。

薬はしばしば、薬をぴったりと保持するタンパク質の「ポケット」の内側に結合し、タンパク質の機能を妨害します。 科学者は、ウイルスタンパク質の3D構造から潜在的な薬物結合ポケットを特定できます。 しかし、時間の経過とともに、ウイルスはタンパク質ポケットを変異させ、薬物が適合しなくなる可能性があります。 しかし、いくつかの薬物結合ポケットは、タンパク質の機能に非常に重要であるため、変異させることができず、これらの配列は、一般に、同じウイルスおよび関連するウイルスで長期間保存されます。 Matthieu Schapiraらは、COVID-19患者サンプルおよび他のコロナウイルスからのウイルスタンパク質で最も高度に保存された薬物結合ポケットを見つけ、汎コロナウイルス薬の最も有望な標的を明らかにしたいと考えていました。

チームはコンピューターアルゴリズムを使用して、15個のSARS-CoV-2タンパク質の3D構造における薬物結合ポケットを特定しました。 その後、研究者らは27種のコロナウイルスで対応するタンパク質を発見し、薬物結合ポケットでそれらの配列を比較しました。 最も保存されている2つの創薬可能部位は、ヘリカーゼnsp13のRNA結合部位と重なるポケットと、RNA依存性RNAポリメラーゼnsp12の触媒部位を含む結合ポケットでした。 これらのタンパク質は両方とも、ウイルスのRNA複製と転写に関与しています。 nsp13の薬物結合ポケットは、COVID-19患者から採取された数千のSARS-CoV-2サンプルで最も高度に保存されており、単一の変異はありませんでした。 研究者らは、nsp12の触媒部位を標的とする新規抗ウイルス薬は現在COVID-19の第II相および第III相臨床試験中であり、nsp13のRNA結合部位はこれまで未踏の標的であり、薬剤開発の優先度が高いはずであると述べています。

ソース:

ジャーナルリファレンス:

Yazdani、S。、 etal。 (2021)SARS-CoV-2ポケットオームの遺伝的多様性。 プロテオーム研究ジャーナル。 doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00206



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